YZF-R1Sの買取相場は年式や走行距離、車体の状態によって異なりますが、目安としては40万円～80万円程度です。特に低走行・ノーマル車両は高値がつきやすく、状態や人気カラーによってはさらに高額査定も期待できます。

YZF-R1SはYZF-R1より装備が簡略化された北米仕様モデルのため、買取価格も若干低めになる傾向があります。ただし、年式やコンディション次第ではYZF-R1と同等の評価がつくこともあります。

事故歴があるYZF-R1Sやカスタム仕様でも買取可能です。状態によっては査定額に影響はありますが、パーツや希少性によってはプラス査定になることもあります。